Hijo del famoso Alessandro Allori, fue figura capital del manierismo toscano y discípulo e imitador de Broncino. A diferencia de su padre, e incluso en abierta pugna con él, se adhirió desde muy pronto al grupo de artistas que se inspiran en la técnica y carácter de la pintura veneciana y rompen con la técnica fría y esmaltada de la tradición florentina. Trabajó algún tiempo en el taller de Gregorio Pagani y llevó adelante interesantes experiencias de la materia pictórica libre y abocetada, tal como había intentado el Cigoli. Su prestigio fue grande y alguna de sus obras más conocidas, especialmente la famosísima Judith, cuenta entre las obras más reproducidas y estimadas de todo el seicento italiano.